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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202211171081.2 (22)申请日 2022.09.24 (71)申请人 福建农林大 学 地址 350002 福建省福州市仓山区上 下店 路15号 (72)发明人 魏丽芳 李军 陈楠 叶欣怡  周晗 徐宏韬 杨长才 陈日清  (74)专利代理 机构 福州元创专利商标代理有限 公司 35100 专利代理师 蔡学俊 薛金才 (51)Int.Cl. G06T 7/00(2017.01) G06T 7/12(2017.01) G06N 3/04(2006.01) G06N 3/08(2006.01) (54)发明名称 基于Transformer和卷积神经网络的三维医 学图像分割方法 (57)摘要 本发明提出一种基于Transformer和卷积神 经网络的三维医学图像分割方法, 包括以下步 骤: 步骤S1: 对原始医学图像的标签图的边缘进 行逐类提取; 步骤S2: 对原始医学图像的原图、 标 签图和标签图的边缘图像进行随机翻转、 旋转和 缩放处理; 步骤S3: 将处理后的图像输入医学图 像分割模型进行各类组织器官的分割; 所述医学 图像分割模型是由训练集数据经过标签图的边 缘提取后再对原图、 标签图和标签图边缘图像随 机翻转、 旋转和缩放处理后产生的图像数据在基 于Transformer和卷积神经网络的结合形态结构 学习的网络模 型进行训练获得。 应用该技术方案 可实现增强最终分割结果的准确性。 权利要求书2页 说明书4页 附图1页 CN 115457009 A 2022.12.09 CN 115457009 A 1.基于Transformer和卷积神经网络的三维医学图像分割方法, 其特征在于, 包括以下 步骤: 步骤S1: 对原 始医学图像的标签图的边 缘进行逐类提取; 步骤S2: 对原始医学图像的原图、 标签图和标签图的边缘图像进行随机翻转、 旋转和缩 放处理; 步骤S3: 将处 理后的图像输入医学图像分割模型进行 各类组织器官的分割。 2.根据权利要求1所述的基于Transformer和卷积神经网络的三维医学图像分割方法, 其特征在于: 所述 步骤S1具体包括以下步骤: 步骤S11: 通过独热编码One ‑Hot对医学图像的标签图的各个类别进行逐通道的分离, 每个通道代表一个类别; 步骤S12: 对分离出来的每个类别通道进行边缘提取, 然后压缩成一个通道, 得到最终 的各类组织器官的边 缘。 3.根据权利要求1所述的基于Transformer和卷积神经网络的三维医学图像分割方法, 其特征在于: 所述 步骤S2具体包括以下步骤: 通过python内置的random函数随机生成在区间[0,1]的一个数作为图像翻转、 旋转的 概率, 并将处 理后的图像缩放至指定大小。 4.根据权利要求1所述的基于Transformer和卷积神经网络的三维医学图像分割方法, 其特征在于: 所述 步骤S3具体包括以下步骤: 医学图像分割模型是由训练集数据 经过标签图的边缘提取后再对原图、 标签图和标签 图边缘图像随机翻转、 旋转和缩放处理后产生的图像数据在基于Tr ansformer和卷积神经 网络的结合形态结构学习的网络模型进行训练获得。 5.根据权利要求4所述的基于Transformer和卷积神经网络的三维医学图像分割方法, 其特征在于: 基于Transformer和卷积神经网络的结合形态结构学习的网络模型在采用 TransUNet网络模 型架构的基础上, 结合形态结构模块学习分割目标在形状上的信息, 采用 最大池化和平均池化学习更丰富的特征; 网络包含模块化的形态结构模块, Transformer 层, 残差模块层, 最大池化和平均池化层, 批标准化层和RELU激活函数, 级联上采样层和 跳 跃连接; 图像经过网络处理后, 生成通道数与图像大小分别原图的类别数和大小都相同的 预测分割结果, 所述预测分割图像用于与真实分割图像 计算及损失函数输出值。 6.根据权利要求5所述的基于Transformer和卷积神经网络的三维医学图像分割方法, 其特征在于: 对基于Transformer和卷积神经网络的结合形态结构学习的分割网络使用三 种损失函数, 分别 是: DICE损失函数, 交叉熵损失函数和二分类交叉熵损失函数, 损失函数 分别表示 为: 权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115457009 A 2其中, y表示真值图中每个像素点在Ont ‑Hot编码下的各个类的值, 表示预测图中每个 像素点在Ont ‑Hot编码下的各个类的值, Ω表 示图像高度为m, 宽度为n, 类别数为K的所有像 素的域, 形状为m ×n×K。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115457009 A 3

.PDF文档 专利 基于Transformer和卷积神经网络的三维医学图像分割方法

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